Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms