Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms