Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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LTC4SQ16873 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LTC4SQ16873 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LTC4SQ16873 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LTC4SQ16873 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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LTC4SQ16873 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LTC4SQ16873 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LTC4SQ16873 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LTC4SQ16873 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LTC4SQ16873 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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LTC4SQ16873 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LTC4SQ16873 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LTC4SQ16873 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LTC4SQ16873 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LTC4SQ16873 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LTC4SQ16873 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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