Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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SGCAQ16586 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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SGCAQ16586 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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SGCAQ16586 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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SGCAQ16586 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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SGCAQ16586 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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SGCAQ16586 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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SGCAQ16586 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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SGCAQ16586 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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SGCAQ16586 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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SGCAQ16586 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SGCAQ16586 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SGCAQ16586 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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