Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SIX1Q15475 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SIX1Q15475 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SIX1Q15475 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SIX1Q15475 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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