Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms