Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC3Q14574 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms