Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
APOFQ13790 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
APOFQ13790 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
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