Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1SQ13698 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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