Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CUL3Q13618 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CUL3Q13618 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CUL3Q13618 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CUL3Q13618 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CUL3Q13618 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CUL3Q13618 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CUL3Q13618 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CUL3Q13618 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CUL3Q13618 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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