Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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PMS2P3Q13401 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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PMS2P3Q13401 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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PMS2P3Q13401 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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PMS2P3Q13401 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
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PMS2P3Q13401 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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PMS2P3Q13401 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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PMS2P3Q13401 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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PMS2P3Q13401 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P3Q13401 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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