Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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PDE3BQ13370 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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PDE3BQ13370 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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PDE3BQ13370 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE3BQ13370 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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