Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHAF1BQ13112 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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