Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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PTPN13Q12923 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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PTPN13Q12923 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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PTPN13Q12923 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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PTPN13Q12923 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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PTPN13Q12923 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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