Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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TWF1Q12792 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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TWF1Q12792 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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TWF1Q12792 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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