Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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AP1B1Q10567 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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AP1B1Q10567 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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AP1B1Q10567 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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