Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms