Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNDQ07001 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNDQ07001 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms