Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FMODQ06828 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FMODQ06828 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FMODQ06828 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FMODQ06828 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FMODQ06828 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FMODQ06828 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FMODQ06828 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FMODQ06828 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms