Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GABPAQ06546 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms