Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPIBQ01892 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms