Protein–RNA interactions for Protein: P98187

CYP4F8, Cytochrome P450 4F8, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F8P98187 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYP4F8P98187 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F8P98187 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYP4F8P98187 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms