Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX1P78337 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX1P78337 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX1P78337 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms