Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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ERVPABLB-1P60509 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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ERVPABLB-1P60509 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ERVPABLB-1P60509 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ERVPABLB-1P60509 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ERVPABLB-1P60509 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ERVPABLB-1P60509 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ERVPABLB-1P60509 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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