Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA8P53708 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms