Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms