Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FNTBP49356 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FNTBP49356 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FNTBP49356 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FNTBP49356 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FNTBP49356 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FNTBP49356 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FNTBP49356 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FNTBP49356 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FNTBP49356 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FNTBP49356 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FNTBP49356 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms