Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL1P40616 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL1P40616 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL1P40616 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms