Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms