Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNGA1P29973 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms