Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRABP1P29762 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms