Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms