Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GM2AP17900 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GM2AP17900 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GM2AP17900 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GM2AP17900 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GM2AP17900 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GM2AP17900 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GM2AP17900 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GM2AP17900 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GM2AP17900 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GM2AP17900 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GM2AP17900 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GM2AP17900 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GM2AP17900 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GM2AP17900 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GM2AP17900 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GM2AP17900 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GM2AP17900 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms