Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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