Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HKR1P10072 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HKR1P10072 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HKR1P10072 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HKR1P10072 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HKR1P10072 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HKR1P10072 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HKR1P10072 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HKR1P10072 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HKR1P10072 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HKR1P10072 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HKR1P10072 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HKR1P10072 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HKR1P10072 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HKR1P10072 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HKR1P10072 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HKR1P10072 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HKR1P10072 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HKR1P10072 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HKR1P10072 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HKR1P10072 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HKR1P10072 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HKR1P10072 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HKR1P10072 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HKR1P10072 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HKR1P10072 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HKR1P10072 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HKR1P10072 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HKR1P10072 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HKR1P10072 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HKR1P10072 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HKR1P10072 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HKR1P10072 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HKR1P10072 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms