Protein–RNA interactions for Protein: P0CG33

GOLGA6D, Golgin subfamily A member 6D, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6DP0CG33 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOLGA6DP0CG33 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GOLGA6DP0CG33 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms