Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI1P08151 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI1P08151 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI1P08151 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI1P08151 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI1P08151 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI1P08151 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI1P08151 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI1P08151 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI1P08151 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI1P08151 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI1P08151 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms