Protein–RNA interactions for Protein: P07357

C8A, Complement component C8 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8AP07357 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8AP07357 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8AP07357 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 400.7 ms