Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRATO95237 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRATO95237 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms