Protein–RNA interactions for Protein: O94886

TMEM63A, CSC1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM63AO94886 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM63AO94886 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms