Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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HOXA2O43364 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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HOXA2O43364 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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