Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFS4O43181 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NDUFS4O43181 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NDUFS4O43181 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NDUFS4O43181 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NDUFS4O43181 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NDUFS4O43181 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NDUFS4O43181 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NDUFS4O43181 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NDUFS4O43181 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NDUFS4O43181 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NDUFS4O43181 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NDUFS4O43181 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NDUFS4O43181 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NDUFS4O43181 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NDUFS4O43181 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NDUFS4O43181 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NDUFS4O43181 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
NDUFS4O43181 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NDUFS4O43181 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NDUFS4O43181 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NDUFS4O43181 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NDUFS4O43181 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms