Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TXNDC9O14530 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms