Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms