Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 CH25H-201ENST00000371852 1686 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 RFX5-215ENST00000452671 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 IRAK2-201ENST00000256458 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 TBC1D3F-201ENST00000620210 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 MYO19-203ENST00000610930 3271 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ITGB6-204ENST00000409967 2292 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 CACNA2D3-AS1-201ENST00000471265 2078 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ZNF574-201ENST00000222339 3309 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 TP53I11-220ENST00000533940 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 MED29-207ENST00000615911 3565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AIF1L-201ENST00000247291 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 SEC24B-203ENST00000504968 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AC010969.1-201ENST00000340444 2412 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 SLC25A5-AS1-203ENST00000446986 1874 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 PRKG2-201ENST00000264399 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 SMCR5-201ENST00000543475 2844 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 PIP5K1A-203ENST00000368890 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms