Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms