Protein–RNA interactions for Protein: A4D1Z8

GRIFIN, Grifin, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIFINA4D1Z8 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GRIFINA4D1Z8 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GRIFINA4D1Z8 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GRIFINA4D1Z8 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GRIFINA4D1Z8 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GRIFINA4D1Z8 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GRIFINA4D1Z8 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GRIFINA4D1Z8 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GRIFINA4D1Z8 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GRIFINA4D1Z8 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GRIFINA4D1Z8 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GRIFINA4D1Z8 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GRIFINA4D1Z8 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms