Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms