Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms