Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms